Research facilities and methods

Specialized facilities

Overview of main methods used

  • classical flow cytometry & FACS
  • spectral flow cytometry (in collaboration with CLIP, Cytek Aurora platform)
  • mass cytometry (in collaboration with CLIP)
  • cell cultures, cell expansion, moDC generation, functional and signaling assays
  • ELISA, CLIA, fluorimetry
  • multiplex cytokine assays (Luminex platform)
  • rt-qPCR
  • multiplex RNA/DNA/proteomic expression assays (nanoString platform)
  • western blots

Photos and featured machines

Slide-based cytometrická stanice ScanR (Olympus)

Modulární zobrazovací platforma pro plně automatizované získávání obrazu a analýzu dat z biologických vzorků. Analýza buněčných suspenzí nebo tkáňových řezů v destičkách s jamkami i na sklíčkách. Automatická softwarová detekce objektů. Na detekovaných objektech je prováděna cytometrická analýza - výstup podobný jako u průtokového cytometru.

scanr

nanoString SPRINT Profiler

nanostring

Luminex 100/200 platform

luminex

 

Created: 27. 5. 2019 / Modified: 29. 11. 2021 / Responsible person: RNDr. Jan Lašťovička, CSc.